Entre los objetivos prioritarios de la Asociación se encuentra el de contribuir a la excelencia académica de sus asociados y, por extensión, de todos los profesionales del área de la salud. Para ello el más importante paso es la construcción colectiva de un concepto de Hospital Universitario en el cual confluyan todas las disciplinas existentes en la Universidad Nacional, en respuesta a la obligación de servir de modelo a las demás universidades del país. En la Ley de Talento Humano hay una definición clara sobre lo que debe ser un hospital universitario.